血清:多元统计

PCA — 无监督主成分分析

POS PCA 方差
PC eigenvalue var_pct cum_var_pct
PC1 41413668543 25.397 25.397
PC2 19865949336 12.183 37.579
PC3 15477433792 9.491 47.071
PC4 10374834455 6.362 53.433
PC5 9365294898 5.743 59.176
图 1: POS PCA Score
NEG PCA 方差
PC eigenvalue var_pct cum_var_pct
PC1 47083220101 24.444 24.444
PC2 33163061030 17.217 41.660
PC3 20544569444 10.666 52.326
PC4 12849557994 6.671 58.997
PC5 9712812348 5.042 64.040
图 2: NEG PCA Score

离群样本检测 (Mahalanobis)

📂 PCA 相关产出文件

统计表(TSV)

图(PNG + PDF 高清版)

PLS-DA — 偏最小二乘判别

PLS-DA 汇总
metric value_pos value_neg
n_features 8.456e+03 8156
n_samples 1.700e+01 17
ncomp 2.000e+00 2
perm_Q2_p 0.000e+00 0
perm_R2_p 4.004e-03 0
📂 PLS-DA 相关产出文件

统计表(TSV)

图(PNG + PDF 高清版)

OPLS-DA — 正交偏最小二乘判别

OPLS-DA 汇总(含 999 次置换 P 值)
metric value_pos value_neg
ortho 1.0000 1.0000
pre 1.0000 1.0000
Q2_cum 0.7370 0.8780
Q2_pval 0.0000 0.0000
R2X_cum 0.3460 0.3020
R2Y_cum 0.9810 0.9980
R2Y_pval 0.0511 0.0030
RMSEE 0.0738 0.0255
注记

血清 OPLS-DA Q² 在 0.737 (pos) 和 0.878 (neg),比粪便 (0.652/0.819) 更高 —— 但 7v10 不对称下小样本组易拟合过度,看 pQ²=0.005 仍显著说明判别力可信。

VIP 表

📂 OPLS-DA 相关产出文件

统计表(TSV)

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