宏基因组:功能注释

KEGG 功能注释概况

Vendor 提供 Unigenes 在 KEGG 数据库的注释丰度(相对丰度),分 4 个层级:

  • KO — 最细粒度,单个酶/蛋白功能
  • Level 2 — KEGG 二级通路分类
  • Level 3 — KEGG 三级通路
  • Module — KEGG 功能模块
KEGG 各层级差异特征数 (Wilcoxon p<0.05)
Level Total_features P_lt_05
KO 5243 402
Level 2 47 0
Level 3 361 11
Module 208 11

KO 差异火山图

KEGG KO 差异火山图 (Dep vs Con)

KEGG KO 差异火山图 (Dep vs Con)

阈值:p < 0.05 且 |log2FC| > 0.5。红色为抑郁组上调,蓝色为下调。

KO 层 Top 差异

Module 层差异

联动接口表

下两个文件是 a/ 代谢组学整合分析的输入接口:

  • kegg_ko_relative.tsv — KO × sample 矩阵,5,243 个 KO × 20 样本,可与 a/ 代谢物的 KEGG 注释做 KO 共现/相关
  • species_relative.tsv — Species × sample 矩阵,9,109 物种 × 20 样本(feces 对称 10v10),可与 a/ 粪便差异代谢物做 Spearman/MMVec/mediation
📂 本节相关产出文件

KEGG 丰度表(TSV)

KEGG 差异(每层 2 个文件)

联动接口表

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