功能态打分(19)
通过预定义的小鼠免疫/炎症功能模块基因集,使用 Seurat::AddModuleScore 对每个细胞打分,量化不同功能状态在 Control vs Disease 之间的差异。
19.1 — 功能模块定义
7 个模块涵盖炎症、应激、修复三大类生物学过程:
| 模块 | 含义 | 代表基因 |
|---|---|---|
| Proinflammatory | 促炎反应 | Il1b, Tnf, Il6, Cxcl1/2, Ccl3/4, Nos2 |
| Anti_inflammatory | 抗炎/调节 | Tgfb1, Il10, Arg1, Cd274, Socs3, Mrc1 |
| Oxidative_Stress | 氧化应激 | Sod1/2, Cat, Gpx1, Nfe2l2, Hmox1 |
| Apoptosis | 细胞死亡 | Bax, Bcl2, Casp3, Casp1, Ripk3, Mlkl |
| ECM_Remodeling | 基质重塑 | Mmp2/9, Col1a1, Col3a1, Fn1, Timp1 |
| Proliferation | 增殖 | Mki67, Top2a, Pcna, Stmn1, Cdk1 |
| IFN_Response | 干扰素应答 | Isg15, Ifit1/2/3, Rsad2, Irf7, Stat1 |
19.2 — UMAP 上的功能得分
19.3 — 组间比较(Violin)
19.4 — 各亚群得分热图
19.5 — 统计检验
每个模块在 Control vs Disease 间做 Wilcoxon 检验,BH 矫正得 p_adj。


