亚群分析(14, 17)

对重点亚群进行重聚类(14),识别 Disease 富集的细胞状态;并通过 Pseudobulk + 样本相关性(17)评估生物学重复一致性。

14 — 重聚类与 Disease 富集亚群

去除潜在污染(其他细胞类型 marker 阳性的 cluster)后重聚类,比较各亚群在 Control / Disease 的占比,识别 Disease 中富集的状态。

重聚类亚群分布 + Disease 富集分析

重聚类亚群分布 + Disease 富集分析

亚群 marker 基因

Disease 富集亚群 vs 其他亚群 DEG

Disease 富集亚群 GO 富集

17 — Pseudobulk + 样本一致性

每个样本聚合为一个 pseudobulk profile,计算 Pearson 相关性,验证生物学重复一致性 + 组间差异。

样本-样本相关性热图(Pearson)

样本-样本相关性热图(Pearson)

各细胞类型 DEG 数量条形图

各细胞类型 DEG 数量条形图
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