差异分析（04-09）
本章涵盖差异表达分析：先在全部细胞类型上做组间比较以选出”重点亚群”（04），然后聚焦该亚群做精细的差异分析（05-09）。
04 — 细胞比例 + 全细胞类型 DE
细胞比例检验
每个细胞类型在 Disease vs Control 的细胞比例做 t 检验，识别比例显著变化的亚群。
全局火山图
各细胞类型 DEG 数量
| cell_type | total |
|---|---|
| Macrophages | 4514 |
| Fibroblasts | 2956 |
| Granulocytes | 2823 |
| Monocytes | 2750 |
| Adipocytes | 1185 |
05 — 重点亚群 DEG（火山图 + 热图）
07 — Top DEG 热图（细化）
09 — 关键基因可视化
Violin Plot
Dot Plot
Feature Plot（split）
📂 本节相关产出文件
统计表
- 04_celltype_proportion_test.csv — 细胞比例检验 | 在线下载 | 本地查看
- 04_DEG_global_DvsC.csv — 全局 DEG | 在线下载 | 本地查看
- 04_DEG_DvsC_per_celltype.csv — 各细胞类型 DEG | 在线下载 | 本地查看
- 04_DEG_summary_per_celltype.csv — 各细胞类型 DEG 数量 | 在线下载 | 本地查看
- 04_celltype_rank_by_DEG.csv — 重点亚群排名 | 在线下载 | 本地查看
- 05_DEG_Disease_vs_Control.csv — 重点亚群 DEG | 在线下载 | 本地查看
图（PDF 高清版）