轨迹推断（10-11）

使用 Monocle3 对重点亚群进行拟时序分析，识别细胞分化/激活轨迹与驱动基因。

10 — Monocle3 轨迹

Monocle3 拟时序轨迹（按 cluster 着色）+ 拟时序梯度

Control vs Disease 拟时序分布对比

11 — 拟时序驱动基因

通过 graph_test（Moran’s I）识别沿轨迹显著变化的基因。

拟时序驱动基因表达模式

📂 本节相关产出文件

数据

• 10_monocle3_cds.rds — Monocle3 cell_data_set 对象 | 在线下载 | 本地查看
• 11_Pseudotime_Genes_Statistics.csv — 拟时序驱动基因统计 | 在线下载 | 本地查看

图（PDF 高清版）

• 10_Monocle3_Trajectory.pdf
• 10_Trajectory_Split.pdf
• 11_Pseudotime_Genes.pdf