富集分析（12-13）

本章涵盖 DEG 全表导出（12）和 GO/KEGG 富集分析（13）。

12 — DEG 全表导出

将前面各对比组的差异基因汇总为一个 Excel 文件，方便老师直接查阅和筛选。

文件 12_DEG_All_Comparisons.xlsx 包含多个 sheet：

  • D vs C 全部 DEG
  • S vs D 全部 DEG
  • Rescue 基因列表
  • 各对比的显著基因筛选

13 — GO / KEGG 富集

对 D vs C 和 S vs D 的显著 DEG 分别做 GO（BP/CC/MF）和 KEGG 通路富集分析。

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

GO + KEGG 富集 DotPlot（所有对比组汇总）

富集结果显示 Disease 组中性粒细胞在以下通路显著激活：

  • 细胞因子-细胞因子受体相互作用
  • NF-κB 信号通路
  • TNF 信号通路
  • 凋亡相关通路

Treatment 组部分通路恢复至 Control 水平。

📂 本节相关产出文件

统计表

图（PDF 高清版）